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设计先从深入解读医疗工艺流程开始，考虑人与空间的尺度比例、心理感受，优化内部各空间的功能、关系及布局，同时利用生态景观来组织串联这些空间，通过”两街一带"、”两个挑空区的处理”两个内庭院”七大亮点设计对空间重新梳理，自然意境在空间中融入，营造出亲切舒适、具有人性的医疗环境。
 
在原始建筑设计中，北面入口的挑空中庭，高度达到35米，过于高耸不适，在室内设计时加建一个玻璃金字塔状的天花， 把挑空区垂直切割为两段，下半段控制在三层楼的高度，空间感舒适;上半段对应的是中医科区域，设计以玻璃金字塔为焦点的中医文化景观区域。与北面入口大厅相对应，针对南面挂号收费、领药大厅的挑空区，室内设计建议用钢结构加建出递进的弧形的挑空平台，并作为医护人员的内部休息交流的空间场所。
 
2008年落成使用的长海医院门诊楼，体量达四万多平米，地下为停车库，地上共有八层，一层为门诊大厅，二至六层为模块化的诊区单元，诊室拥有良好的采光通风，诊区布局采用双通道原则，医患分流，并采用了以器官为中心，医疗功能相关科室集中布置的原则。
标识系统与室内装饰统一规划，采用了符合军旅文化的绿色系，科室入口的门头结合标识系统的标准设计，强化空间秩序感，帮助病人识别科室。在科室的配色方面，则大胆采用了不同的配色方案，妇产科采用了粉红色系，中医科采用了棕色，眼科采用蓝色，并根据科室的主色，橡胶地坪和隔帘等都做了相对应的色彩。